康保３（９６６）年、性空上人（せいくうしょうにん）によって開かれた。「この山に登る者は菩提心を起こし、また峰に棲む者は六根を浄められる」という文殊菩薩のお告げのとおり、摩尼殿上の白山（准てい峰）において上人は悟りを得られた。その後、上人の得を慕い利益（りやく）を得ようという多くの人々の信仰を集め、「西の比叡山」と称され、僧侶の修行の道場として栄えた。西国三十三霊場の二十七番札所でもある。現在、境内は国指定の史跡であり、大講堂や常行堂、金剛堂など建築物８棟と阿弥陀如来像など仏像８体が国重文に指定されている。
（入山のパンフレットより）

仁王門
三つ棟造りの仁王門である。江戸初期の建物。両脇に仁王像が立つ。向かって右側が口を開いた「阿」像、左側が「吽」像。一対で「あ・うんの呼吸」をつくり聖域の守りとなる。これより先が圓教寺境内。
（兵庫県指定文化財）

食堂（じきどう）
承安４（１１７４）年、後白河法皇の勅願で創建。長さが約４０ｍあり、二階建て建築としては他に類を見ない。修行僧の寝食に供した場所と伝えられる。未完成のまま放置されていたのを昭和３８年の解体修理の際に再建完了。現在は１階が写経道場、２階が寺宝の展示館となっていまる。
（国指定重要文化財）

常行堂（じょうぎょうどう）
創建時期不明。常行三昧（ひたすら阿弥陀仏の名を唱えながら本尊を回る修行）をするための道場。建物の構成は、方五間の大規模な東向きの常行堂。北接する長さ十間の細長い建物が楽屋、その中央に張り出した舞台とからなり立っている。内部は、中央に二間四方の瑠璃壇を設け本尊（阿弥陀如来）が安置されています。舞台は、大講堂の釈迦三尊に舞楽を奉納するためのものと思われています。昭和４０年に解体修理。
（国指定重要文化財。本尊の阿弥陀如来も国指定重要文化財）

本多家廟所
大講堂の東南の隅にある。姫路城城主本多家の墓所があり廟屋五棟と本多忠刻らの墓碑が並んでいる。五棟の廟屋は、江戸初期から中期にわたる廟屋の建築として兵庫県下でも例のない珍しいもの。
（兵庫県指定文化財）

開山堂
圓教寺の開祖性空上人を祀る円教寺奥の院の中核をなす堂である。寛弘４（１００７）年、９８歳で上人が世を去った後、弟子の延照律師が創建したといわれる。以来、一千年にわたり燈明が燃え続け、朝夕欠かさず勤行が行われている。現在の建物は寛文１１（１６７１）年に再建されたもので、江戸初期の開山堂建築の代表作。内部は内陣（正堂）と外陣（礼堂）に分かれている。内陣の一部は天台宗の伝統を受け継ぎ、土間となっている。
（兵庫県指定重要文化財）

護法堂拝殿
奥の院の広場を挟んで護法堂と向かい合って建っている。桃山時代の建築物で別名「弁慶の学問所」で知られている。

壽量院
江戸中期の建物。「蔀戸」中門などの寝殿造りの古い形式を備え、内部は、床や違い棚のついた書院造りになっている。もっと古くには、無量壽院と呼ばれ、承安４（１１７４）年には後白河法皇がここに七日間こもって観世音菩薩の加護を願われた。
（国指定重要文化財）

十妙院
建築構造は国指定の重要文化財である壽量院と似ており同建築物を参考にして江戸中期に建築された。仏間を中心とした方丈と台所を設けた庫裡とを会わせた構造で、壽量院と共に円教寺型ともいえる独特の構造を持っている。建物内部には狩野派の画家である狩野永納筆の襖絵が多数残されている。平成４−７年に大修理が行われた。秋のシーズンには特別公開される。（兵庫県指定重要文化財）